不少人認為，若非中、日政府故意「放水」，香港保釣人士不可能登陸釣魚台島。言下之意，民間保釣的「成功」，是中日「勾結」的結果。
種種迹象顯示，中日高層雖然缺乏互信，但兩國在處理被扣的保釣人士，確有默契，且建基於兩項原則。其一，不刺激公眾情緒，盡快結束事件，以免事件發酵、事態擴大，變成一發不可收拾的中日危機。其二，在公開言論及行動中，兩國政府都可強硬一點，以滿足本國高漲的民族主義情緒，從而主導民間的反日\反中活動。
事實上，這樣做也符合兩國政府利益。日本首相野田佳彥民望不振，當南韓總統李明博登上與日本有領土糾紛的獨島之前，支持度已滑落至兩成左右，而登上獨島就獲近八成五韓國人支持；相反，日本政府無力阻撓李明博，野田支持度因而跌破兩成，若再在釣魚台問題過於軟弱，相信倒台不遠矣。同理，北京當局近年鼓吹「愛國主義教育」，民族主義成為中共與民眾的最大共識，也是維繫政權的重要依據。他們開口閉口國家主權、領土完整，斷不可能在釣魚台問題示弱，否則將對中共的愛國主義論述造成致命打擊。
因此，兩國都會理解對方的口頭強硬，不會因對方的「嚴重關切」、「強烈不滿」而動怒。
更重要的是，兩國都不希望事件失控，進而影響實質關係。由兩國官僚掌握事態發展，尚有機會控制破壞的範圍；若由民間自行其事，事件則會不斷升溫，到一發不可收拾時，兩國政府只能遵從民意，採取更強硬極端的行動去回應民間訴求。這是兩國官僚不願看到的。
所以，日方扣留保釣人士十多小時後，就以他們沒有造成執法人員傷亡為由，不以「妨害公務罪」予以起訴，改以非法入境罪名將他們閃電式遣送出境。
不過，若說北京當局故意放香港保釣船出海，既向日方示威，也因港人身份沒那麼敏感，可用「一國兩制」應付日方抗議，實在太高估北京的保釣決心了。保釣船成功出海，與其說是北京暗中放行，毋寧說當局大意，以為啟豐二號也會在稍加阻撓後就回航，而今次水警的攔截力度跟過去差不多，誰知今次保釣人士豁出去，強行衝到公海；到了釣魚台海域，日本軍艦的攔截力度也跟過去一樣，製造海浪、發射水炮之外，還撞擊啟豐二號。若非保釣人士不惜船毀人亡的駕船衝上石灘，他們絕不可能登島。
可以說，如何處理被扣的保釣人士，中日確有默契，但保釣人士能夠成功登島，則更多是他們努力的成果。